Känner du dig osäker på hur du ska skapa ett kladogram med hjälp av ett vanligt bord? Här presenterar vi några kladogramverktyg som kan underlätta processen betydligt.
I biologilektionerna under vår barndom lärde vi oss alla att alla organismer är besläktade på något sätt. Till exempel är apor ansedda som människans förfäder, och vi är alla del av samma näringskedja, bland annat.
Ett kladogramträd illustrerar släktskapet mellan organismer baserat på deras DNA-sekvenser, fysiska attribut och fenotyper. Det fungerar som ett evolutionärt träd som möjliggör kategorisering av olika grupper baserat på liknande egenskaper, evolutionära utvecklingar och anpassningar. Den mest sannolika hypotesen fastställs genom att jämföra och rita upp olika kladogram.
Kladogram använder linjer för att visa hur grupper av organismer eller förfäder är relaterade till varandra. Det är enkelt att följa linjerna till start- och slutpunkterna som representerar de hypotetiska förfäderna.
Vid behov indelas organismerna baserat på molekylär och morfologisk nivå, samt beteendemönster hos djur. Algoritmer används för att generera kladogram och utföra optimeringsuppgifter baserat på inmatade data. Målet är att hitta den optimala lösningen, vilket ofta görs med metoder som simulerad glödgning för att nå ett globalt minimum.
Med detta sagt, här är en lista över verktyg för att skapa kladogram som du kan välja bland.
Skapa kladogram
Med Creately, kan du på ett enkelt sätt visualisera relationer mellan arter. Creately hjälper till att identifiera och illustrera fylogenetiska samband på ett effektivt sätt. Det är ett utmärkt verktyg för att visualisera olika biologiska arter och erbjuder funktioner som:
- Exportera som PDF, SVG och PNG för utskrift och delning
- Flera mallar för fylogenetiska diagram och kladogram
- Enkel visualisering av relationer direkt på arbetsytan
Creately tillhandahåller omfattande formbibliotek, inklusive dikotoma nycklar, näringsvävar, fylogenetiska träd och olika mallar för att gruppera organismer. Verktyget erbjuder en enkel dra-och-släpp-funktion för att skapa relationer med avancerad textformatering och konfigurerbara färgteman.
Med Creately kan du dra och släppa djurbilder och skapa dynamiska kopplingar som smidigt kan expanderas, roteras och storleksändras. Skapa dynamiska kladogram med integrerade Google-bilder för att centralisera forskningsdata, med oändlig arbetsyta, universell fulltextsökning och mångsidiga tabeller.
Det är enkelt att samarbeta med andra med hjälp av markörer i realtid, kommentarsfunktioner och videokonferenser.
Insight Maker
Insight Maker är ett användarvänligt verktyg för att bygga modeller direkt i webbläsaren. Du kan enkelt skapa tillfälliga loopdiagram och visuellt tilltalande bilder samt genomföra simuleringar. Insight Maker underlättar snabb simulering av befolkningsinteraktioner och definition av agenters beteenden.
Insight Maker är lätt att använda:
- Starta verktyget direkt i webbläsaren utan att behöva installera plugins eller programvara.
- Placera dina idéer på arbetsytan för att skapa simuleringsmodeller, detaljerade bilder och insikter.
- Använd simuleringsalgoritmer för att arbeta med agentbaserad och systemdynamisk modellering.
- Samarbeta med ditt team och låt dem ge feedback på designen.
- Använd modellerna gratis och dra nytta av den kreativa kraften.
Dessutom kan användare få en bättre förståelse för kladogram och se vad andra arbetar med. Det främjar idéutbyte och hjälper till att hitta de bästa lösningarna.
Guilford
Använd SimpleClade med Guilford för en idealisk kladistisk analys. Det erbjuder ett grafiskt användargränssnitt för att skapa en enkel arbetsmetod inom paleontologi. Verktyget är enkelt att installera och använda direkt.
Användare kan skapa en CSV-datafil och omedelbart börja generera kladogram. Hela processen med att använda verktyget är enkel att lära sig. Användare kan markera klader som ”OANVÄND” om de inte ska inkluderas och ange värden för andra klader.
Användarna kan starta programmet och välja noder som kan förklara deras frågeställning, ändra anslutningar om det behövs, beräkna sparsamhetsstatistik, ansluta horisontella stammar för utgrupper och se förändringar i egenskapstillstånd.
IUBio
IUBio är ett annat välkänt verktyg för att skapa kladogram, eurogram, swoopogram, curvogram, fenogram och träddiagram. Det är lätt att använda. Ladda upp din trädfil (eller klistra in webbadressen), ange en titel och skicka in informationen.
Användare kan även välja tilläggsalternativ i IUBio för att anpassa resultatet, som bas-URL för etiketter, stil, teckensnitt, storlek osv. Det ger också användaren möjlighet att välja mellan trädtillväxt och nodplacering för att ge diagrammet ett bra utseende.
Onlineverktyget hanterar flera typer av data, som leddjur, DroSpeGe, enGenes, wFleaBase och många fler. Det ger allmänheten tillgång till resurser inom bioinformatik och molekylärbiologi. IUBio inkluderar också Drosophila Genome, sekvensanalys, biosekvenskonverterare och redigeringsverktyg.
Slutsats
Kladogramverktyg låter oss representera evolutionära linjer med grenar och antalet genetiska förändringar som beror på nukleotidsubstitutioner. Det är också enkelt att illustrera transformationer baserat på procentuell förändring i sekvensen.
Det är viktigt att bevara trädstrukturen när man fokuserar på grenar och noder (både inre och yttre noder – löv och spetsar). Diagrammet inkluderar också den molekylära klockan för att uppskatta de gemensamma förfäderna.
Använd ett kladogramverktyg för att få det resultat du önskar.